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La microscopie optique est un outil essentiel de la recherche biologique qui permet d’observer les cellules et les organismes vivants à des échelles inaccessibles à l’oeil nu. Depuis son apparition au XVIIe siècle, elle n’a cessé d’évoluer grâce à des innovations majeures. Les microscopes modernes associent désormais imagerie numérique, optiques avancées et approches computationnelles.
Imagerie photonique pour la biologie présente les principales techniques de microscopie à l’origine de nombreuses avancées en biologie. Cet ouvrage couvre un large éventail de méthodes parmi lesquelles la microscopie en champ clair, la fluorescence, la microscopie confocale, la microscopie à feuille de lumière, le suivi de particules individuelles, les approches de photo-perturbation, la spectroscopie de corrélation de fluorescence et la microscopie de super-résolution. Il s’achève par un chapitre consacré à l’analyse d’images, mettant en lumière les apports récents de l’intelligence artificielle. Chaque chapitre présente les principes des techniques abordées, leurs domaines d’application ainsi que leurs atouts et leurs limites.
1. Principes de la microscopie optique
2. Imagerie sans marquage par contraste et mesure de phase
3. Fluorophores et méthodes de marquage pour la microscopie à fluorescence
4. FRAP et FCS : approches quantitatives
5. Suivi de particules individuelles et dynamique à l’échelle nanométrique dans des échantillons biologiques
6. Microscopie 3D
7. La microscopie à illumination structurée
8. Imagerie STED de la morphologie neuronale
9. Microscopie de molécules uniques pour la biologie cellulaire quantitative
10. Traitement et analyse d’images de microscopie
Jean-Baptiste Sibarita
Jean-Baptiste Sibarita est physicien et spécialiste de l’imagerie cellulaire quantitative. Il dirige une équipe de recherche et développement du CNRS à l’Université de Bordeaux. Il est à l’origine de plusieurs techniques d’imagerie et logiciels innovants.
