Code ERC :

LS2 Genetics, ’Omics’, Bioinformatics and Systems Biology
LS2_12 Bioinformatics
LS2_15 Systems biology

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Analyses des motifs accessibles dans les modèles Kappa

Jérôme FERET
(pages : 337-398)
DOI : 10.51926/ISTE.9029.ch9

Résumé :

Ce chapitre propose un langage de réécriture pour modéliser l’évolution d'ensembles d'instances de protéines et de leurs liaisons. Ce niveau de détail permet une représentation compacte grâce à une description locale des interactions et ouvre la voie à diverses abstractions. En particulier, nous utilisons ici cette structure pour calculer des propriétés locales des complexes protéiques.

Mots-clés :

Réactions biochimiques, réécriture de graphes à sites, analyse statique, interprétation abstraite, accessibilité
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